Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA3O96018 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA3O96018 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA3O96018 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA3O96018 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA3O96018 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA3O96018 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA3O96018 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA3O96018 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA3O96018 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA3O96018 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA3O96018 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA3O96018 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA3O96018 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA3O96018 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA3O96018 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA3O96018 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA3O96018 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA3O96018 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA3O96018 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA3O96018 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA3O96018 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA3O96018 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA3O96018 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA3O96018 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA3O96018 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA3O96018 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA3O96018 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA3O96018 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA3O96018 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA3O96018 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA3O96018 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA3O96018 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
APBA3O96018 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
APBA3O96018 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
APBA3O96018 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APBA3O96018 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APBA3O96018 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA3O96018 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA3O96018 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA3O96018 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA3O96018 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA3O96018 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA3O96018 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA3O96018 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA3O96018 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA3O96018 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA3O96018 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA3O96018 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA3O96018 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA3O96018 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms