Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG12O94817 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms