Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBOX1O75936 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms