Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN5O75503 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN5O75503 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN5O75503 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN5O75503 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLN5O75503 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN5O75503 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms