Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSO75390 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSO75390 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSO75390 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSO75390 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSO75390 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSO75390 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSO75390 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSO75390 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSO75390 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSO75390 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSO75390 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSO75390 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSO75390 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms