Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms