Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KIAA0556O60303 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KIAA0556O60303 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms