Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms