Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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VEGFDO43915 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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