Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MEFVO15553 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MEFVO15553 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MEFVO15553 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MEFVO15553 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MEFVO15553 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MEFVO15553 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MEFVO15553 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MEFVO15553 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MEFVO15553 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MEFVO15553 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MEFVO15553 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MEFVO15553 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MEFVO15553 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MEFVO15553 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MEFVO15553 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MEFVO15553 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MEFVO15553 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MEFVO15553 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MEFVO15553 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MEFVO15553 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MEFVO15553 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MEFVO15553 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms