Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DSR2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DSR2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms