Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1Z3

FER1L4, Fer-1-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FER1L4A9Z1Z3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FER1L4A9Z1Z3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FER1L4A9Z1Z3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FER1L4A9Z1Z3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FER1L4A9Z1Z3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FER1L4A9Z1Z3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FER1L4A9Z1Z3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FER1L4A9Z1Z3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FER1L4A9Z1Z3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FER1L4A9Z1Z3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FER1L4A9Z1Z3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FER1L4A9Z1Z3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FER1L4A9Z1Z3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FER1L4A9Z1Z3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FER1L4A9Z1Z3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FER1L4A9Z1Z3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FER1L4A9Z1Z3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FER1L4A9Z1Z3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FER1L4A9Z1Z3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms