Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCNX2A6NKB5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCNX2A6NKB5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms