Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms