Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL33A6NCF5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL33A6NCF5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms