Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKD2Q13563 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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PKD2Q13563 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PKD2Q13563 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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PKD2Q13563 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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PKD2Q13563 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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PKD2Q13563 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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PKD2Q13563 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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PKD2Q13563 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKD2Q13563 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKD2Q13563 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKD2Q13563 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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PKD2Q13563 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PKD2Q13563 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKD2Q13563 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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PKD2Q13563 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKD2Q13563 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKD2Q13563 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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PKD2Q13563 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKD2Q13563 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKD2Q13563 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKD2Q13563 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKD2Q13563 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKD2Q13563 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKD2Q13563 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKD2Q13563 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKD2Q13563 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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