Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms