Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC85BQ15834 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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