Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A4Q9Y6R1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms