Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX9Q9Y5X1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX9Q9Y5X1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX9Q9Y5X1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX9Q9Y5X1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX9Q9Y5X1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX9Q9Y5X1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX9Q9Y5X1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX9Q9Y5X1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX9Q9Y5X1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX9Q9Y5X1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SNX9Q9Y5X1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SNX9Q9Y5X1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX9Q9Y5X1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms