Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TNPO3Q9Y5L0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms