Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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HECTD4Q9Y4D8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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HECTD4Q9Y4D8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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