Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NRXN3Q9Y4C0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN3Q9Y4C0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms