Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms