Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LEMD3Q9Y2U8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms