Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNQ9UQP3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms