Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC5Q9UQL6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms