Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms