Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX7Q9UNH6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms