Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms