Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms