Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARRES3Q9UL19 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RARRES3Q9UL19 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARRES3Q9UL19 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARRES3Q9UL19 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARRES3Q9UL19 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARRES3Q9UL19 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARRES3Q9UL19 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARRES3Q9UL19 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RARRES3Q9UL19 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARRES3Q9UL19 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms