Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms