Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms