Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG3Q9UJ98 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STAG3Q9UJ98 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms