Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA6Q9UF33 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms