Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNAL1Q9UBT7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms