Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms