Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COMMD9Q9P000 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD9Q9P000 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms