Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMOD2Q9NZR1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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