Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GDE1Q9NZC3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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