Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK13-1Q9NX77 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms