Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms