Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAK1IP1Q9NWT1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms