Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms