Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL1Q9NSC2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms