Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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LTBP3Q9NS15 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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LTBP3Q9NS15 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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LTBP3Q9NS15 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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LTBP3Q9NS15 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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LTBP3Q9NS15 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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LTBP3Q9NS15 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LTBP3Q9NS15 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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