Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms