Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms