Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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